Computacional

COMUNICADO: O cluster SGI foi desativado devido a impossibilidade de reparo por falta de peças de reposição. Durante uma queda de rede elétrica o cluster e o Nobreak que o suportavam foram gravemente avariados. Não sendo viável economicamente o reparo desse sistema.

Durante o tempo de funcionamento do Cluster SGI (2010-2021), foram executados 52153 cálculos.

Através de uma parceria entre o LAME e o Laboratório de Química Computacional está disponível um Cluster SGI localizado na sala IQ-100, que atende exclusivamente alunos e professores envolvidos com o Programa de Pós-Graduação de Química da UFF. O sistema atual foi adquirido através do projeto:

Modelagem molecular aplicada ao desenvolvimento racional de moléculas funcionais. Coordenador: José Walkimar de Mesquita Carneiro (UFF). Integrantes: UFF – Fabio da Silva Miranda, Maria Domingues Vargas, Célia Machado Ronconi, Mauricio Lanznaster, Marciela Scarpellini, Jackson Antônio Lamounier Camargos Resende, Martha Teixeira de Araújo; UERJ – Mauricio Tavares de Macedo Cruz. FAPERJ Pensa Rio – Edital 19/2011 – Apoio ao Estudo de Temas Relevantes e Estratégicos para o Estado do Rio de Janeiro – 2011. Processo: E-26/110.692/2012. Período: 2012-2015. Concluído em 10/2014.

 

Pesquisadores interessados em usar os recursos computacionais do cluster promécio para si ou para seus alunos devem preencher o formulário de cadastramento de usuários.

Cluster 2014 10 Frente Cluster 2014 10 Frente aberta Cluster 2014 10 traseira

Figura 1. Vistas do sistema computacional.

 

 O sistema é composto de:

1 nó de gerenciamento (headnode) SGI Altix Xe 250 (8 processadores)

8 nós SGI Altix Xe 320 (8 processadores cada)

8 nós SGI Altix Xe 340 (12 processadores cada)

2 nós SGI C2112-4RP4 (96 procesadores cada)

 

O sistema é gerenciado pelo Prof. Fabio da Silva Miranda e tem o apoio do Laboratório de Química Computacional (Coordenado pelo Prof. José Walkimar de Mesquita Carneiro). O Cluster opera com o sistema Linux (Suse 11), possui gerenciador de fila (PBS/Torque - Maui) e tem a disposição os seguintes softwares instalados:

TURBOMOLE 6.6

Gaussian 09

Gaussview 5

ORCA 3.0.1

GAMESS 2013-R1

Quantum Espresso 5.1

NWchem 6.3-R2

VASP 4.5

CP2K 2.2

AMBER 12

GROMACS 4.6

NAMD 2.9

MOPAC

Compilador Intel Cluster Studio 2013

Compilador PGI 11.10

 

Nobreak CM-Comandos 2014 10 frente

Figura 2. Nobreak CM Comandos 30 kVA que alimenta o cluster.

 

Contato:
IQ-504 (gabinete)
Tel.: (+55-21) 2629-2224